"X-Men '97" es una secuela directa de la serie animada "X-Men: La serie animada" (1992-1997), que retoma la historia después de los eventos finales de la serie original. Con la pérdida de su mentor, el Profesor X, la troupe mutante se enfrenta a nuevos y peligrosos desafíos. La serie, producida por Marvel Studios Animation, cuenta con Beau DeMayo como guionista principal y productor ejecutivo, mientras que Jake Castorena asume el rol de director supervisor.

Después de que Charles Xavier muriera, los X-Men se encuentran en un mundo que aún no los acepta y deben enfrentar el dilema de ser liderados por Magneto, quien es tanto antagonista como amigo del Profesor X y posiblemente el heredero de la dirección de la escuela.